Informe de Science: La variante Delta desencadena una nueva fase peligrosa en la pandemia

En el Reino Unido, Delta ya representa más del 90% de todas las infecciones; ha vuelto a aumentar el número de casos de COVID-19 después de una caída dramática y llevó al gobierno la semana pasada a posponer la etapa final de su plan de reapertura.

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El siguiente es un informe publicao por Science ** y dada su relevancia reproucimos íntegramente:

Cuando la variante del coronavirus ahora llamada Delta apareció por primera vez en diciembre de 2020, en el estado indio de Maharashtra, no parecía tan notable. Pero cuando llegó a Nueva Delhi unos meses después, su impacto fue devastador, con casi 30.000 casos reportados diariamente a finales de abril. «De repente … es dominante y barre completamente a Alpha», que hasta entonces era más frecuente en la ciudad, dice Anurag Agrawal, quien dirige el Instituto de Genómica y Biología Integrativa en Nueva Delhi.

Nueva Delhi parecía poco probable que sufriera un gran brote nuevo porque muchos de sus residentes ya habían sido infectados o vacunados, dice Agrawal. Pero esas protecciones parecían ralentizar apenas a Delta, que es más transmisible y puede evadir la inmunidad, dice: «Pasó de un muro de 10 pies alrededor de la ciudad a un muro de 2 pies por el que simplemente se podía caminar».

Desde Nueva Delhi, la variante se ha extendido rápidamente y ahora parece que va a barrer el mundo en lo que podría ser una nueva ola devastadora. En el Reino Unido, Delta ya representa más del 90% de todas las infecciones; ha vuelto a aumentar el número de casos de COVID-19 después de una caída dramática y llevó al gobierno la semana pasada a posponer la etapa final de su plan de reapertura. Un resurgimiento impulsado por Delta en Lisboa llevó al gobierno portugués a promulgar una prohibición de viaje de 3 días entre la ciudad y el resto del país. La variante puede representar el 90% de todos los casos de COVID-19 en la Unión Europea a fines de agosto, advirtió hoy Andrea Ammon, directora del Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. “Es muy probable que la variante Delta circule ampliamente durante el verano, particularmente entre las personas más jóvenes que no son el objetivo de la vacunación”, dijo. “Esto podría causar un riesgo de que las personas más vulnerables se infecten y experimenten enfermedades graves y muerte si no están completamente vacunados ”.

Delta también parece estar causando aumentos repentinos en Rusia, Indonesia y muchos otros países. En los Estados Unidos, donde ahora se estima que su prevalencia es de al menos el 14%, los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades declararon a Delta una «variante de preocupación» el 15 de junio.

El aumento ha desencadenado un frenesí de investigación para comprender por qué Delta parece propagarse mucho más rápido que las otras tres variantes de preocupación, si es más peligroso de otras maneras y cómo su patrón único de mutaciones, que causa cambios sutiles en su proteínas, pueden causar estragos. La llegada de Delta también ha llamado la atención sobre el potencial del SARS-CoV-2 para evolucionar y adaptarse en los meses y años venideros. Por el momento, Delta es una amenaza particular para los países más pobres con poco o ningún acceso a las vacunas, dice Soumya Swaminathan, asesor científico en jefe de la Organización Mundial de la Salud. «Mi preocupación inmediata es lo que sucederá cuando Delta se introduzca en África», dice. «Podría terminar con brotes explosivos».

La investigación de Public Health England subraya la capacidad de Delta para propagarse. En comparación con Alpha, que apareció en el Reino Unido en 2020, «está obteniendo estimaciones de 50% o 100% más de transmisión», dice Adam Kucharski, modelador de la Escuela de Higiene y Medicina Tropical de Londres.

Pero Kucharski dice que la protección reducida de las vacunas también puede influir. Los datos de Inglaterra y Escocia indican que las vacunas Pfizer-BioNTech y AstraZeneca ofrecen una protección ligeramente menor contra las infecciones sintomáticas de la nueva variante que de Alpha. Las personas que han recibido una sola inyección, como muchos residentes del Reino Unido, son especialmente vulnerables. (Dos dosis de cualquiera de las vacunas aún ofrecen el mismo alto nivel de protección contra la hospitalización de Delta.) No está claro qué tan bien las muchas otras vacunas que se usan actualmente en todo el mundo protegen contra ella, y hay pocos datos sobre la protección resultante de una combate de COVID-19.

Los dos efectos, mayor transmisibilidad y evasión inmune, son difíciles de desenredar, pero «Yo diría que la variante Delta ha sido impulsada por su transmisibilidad, no por su capacidad para escapar de la inmunidad», dice Jeremy Farrar, director de Wellcome Trust. «Si Alpha realmente es aproximadamente un 50% más transmisible que la cepa de tipo salvaje, y Delta es un 50% más transmisible de nuevo que Alpha, estamos hablando de un virus que es más del doble de transmisible que la cepa inicial», agrega Aris Katzourakis. virólogo evolutivo de la Universidad de Oxford. Eso significaría que es probable que los países y las poblaciones con bajas tasas de vacunación experimenten grandes brotes nuevos. De hecho, si la propagación más rápida «se debe completamente a los fundamentos del virus, es una noticia catastrófica para el resto del mundo», dice Kucharski.

Además de esto, es más probable que Delta ponga a personas no vacunadas en el hospital que Alpha. Los primeros datos del Reino Unido sugieren que el riesgo de hospitalización puede ser el doble. Juntas, estas características podrían causar grandes problemas en África, dice Swaminathan. “Allí no habrá suficiente oxígeno, no habrá suficientes camas de hospital. Y ya sabemos que los resultados para las personas hospitalizadas en África son peores que en otros países ”, dice. «Así que esto realmente podría conducir a una mayor mortalidad, incluso entre las personas más jóvenes».

Las mutaciones pueden frustrar los anticuerpos

Los científicos recién están comenzando a investigar qué es lo que hace que Delta sea tan peligrosa. Se están concentrando en un conjunto de nueve mutaciones en el gen que codifica el pico, la proteína que tachona la superficie del virus y le permite invadir las células humanas. Una mutación importante, llamada P681R, cambia un aminoácido en un punto directamente al lado del sitio de escisión de la furina, donde una enzima humana corta la proteína, un paso clave que permite que el virus invada las células humanas. En la variante Alpha, una mutación en ese sitio hizo que la escisión fuera más eficiente; una preimpresión publicada a fines de mayo  mostró que el cambio diferente de Delta hace que la división de la furina sea aún más fácil. Los investigadores sugieren que esto podría hacer que el virus sea más transmisible.

Sin embargo, los investigadores japoneses que crearon pseudovirus que llevan la mutación  no han encontrado  que confiera una mayor infectividad en el laboratorio, y en la India, otras variantes de coronavirus que incluyen la misma mutación han tenido mucho menos éxito que Delta, dice el virólogo evolutivo Andrew Rambaut de la Universidad de Edimburgo. «Por lo tanto, debe ser una interacción con algo más en el genoma».

Otras mutaciones en Delta podrían ayudarlo a frustrar la inmunidad. Algunos alteran el dominio N-terminal (NTD) de la espiga, que sobresale de la superficie de la proteína. Un  reciente  artículo de Cell  identificado un lugar en el NTD como un “super-sitio”, indefectiblemente dirigido por anticuerpos neutralizantes “ultrapotentes” de pacientes recuperados. Las mutaciones únicas de Delta eliminan los aminoácidos en las posiciones 156 y 157 en el supersitio y cambian el aminoácido 158 de arginina a glicina; este último elimina un punto de contacto directo para la unión de anticuerpos, dice David Ostrov, biólogo estructural de la Universidad de Florida. «Creemos que la mutación 157/158 es una de las mutaciones distintivas en Delta que le ha dado este fenotipo más de evasión inmune», coincide Trevor Bedford, biólogo computacional del Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson.

Otra mutación en el superitio NTD también puede ayudar a rechazar los anticuerpos. Y los científicos deberían comenzar a examinar el papel de los cambios en otras proteínas variantes de Delta, dice Nevan Krogan, biólogo molecular de la Universidad de California en San Francisco. “Hay tanto que no sabemos sobre estas variantes en todos los niveles. Estamos tan a oscuras «. Delta tiene varias mutaciones en la proteína nucleocápsida, por ejemplo, que tiene muchas funciones, «como una proteína Swiss Army Knife», dice el virólogo David Bauer del Instituto Francis Crick. Sin embargo, los experimentos para aportar claridad llevarán meses.

Acelerar las vacunaciones

Mientras tanto, los científicos están de acuerdo en que se necesitan acciones urgentes para detener la propagación de la nueva variante. “Las preocupaciones sobre Delta deberían impulsarnos a intensificar realmente los esfuerzos de vacunación y aumentar las vacunas a los lugares donde Delta está avanzando”, dice la viróloga Angela Rasmussen de la Universidad de Saskatchewan. El presidente de los Estados Unidos, Joe Biden,  ha instado a los estadounidenses vacunarse por completo para protegerse de Delta. Ammon pidió hoy a los países europeos que aceleren los planes para vacunar completamente a las poblaciones vulnerables; Mientras tanto, dijo, se deben mantener las restricciones para evitar que la nueva variante se propague y cause otro aumento en los casos, hospitalizaciones y muertes. Los países con poco acceso a la vacuna deben recurrir nuevamente a intervenciones como el distanciamiento físico y las máscaras, dice Rasmussen. Y en Europa, Ammon pidió a los países que hicieran ambas cosas: mantener las restricciones vigentes mientras presionan para vacunar completamente a las poblaciones vulnerables.

El objetivo no es solo salvar vidas inmediatamente, sino también darle al virus menos espacio para evolucionar más. El éxito de Delta ha demostrado que los científicos no pueden identificar nuevas variantes peligrosas a tiempo para detener su propagación, dice Emma Hodcroft, viróloga de la Universidad de Basilea, a pesar de un esfuerzo global sin precedentes para  rastrear su evolución en tiempo real . Y sería peligroso asumir que el SARS-CoV-2 no puede funcionar mucho mejor, dice Katzourakis. «Todo lo que ha sucedido al menos dos veces en la evolución es parte de un patrón», dice. «No me sorprendería mucho si viéramos cambios equivalentes durante los próximos dos años».

**Artículo escrito por: Por Kai Kupferschmidt , Meredith Wadman

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